《教父3》中汤姆·哈根角色的缺失，是该片的一大遗憾。作为科莱昂家族的养子，由罗伯特·杜瓦尔饰演的汤姆·哈根，在1972年的《教父》中是关键角色之一。在桑尼和维托相继离世后，汤姆·哈根在《教父2》中的戏份更加吃重，甚至一度暂代迈克尔成为科莱昂家族的教父。
尽管汤姆·哈根对整个系列极为重要，但罗伯特·杜瓦尔并未出演《教父3》，他是唯一一个被排除在外的主要幸存角色。影片中提到，汤姆·哈根在《教父2》与《教父3》之间因病去世，并非死于黑手党内部的勾心斗角。不过，罗伯特·杜瓦尔拒绝出演《教父3》背后的真实原因并非如此简单。
罗伯特·杜瓦尔未出演《教父3》，源于一场合同纠纷。这并非个人恩怨，纯粹是生意问题。弗朗西斯·福特·科波拉导演原本为杜瓦尔安排了重要角色，但双方在财务问题上未能达成一致，谈判破裂，导致汤姆·哈根在《教父3》中的角色被彻底删除。
据科波拉在《教父3》的DVD评论中透露，罗伯特·杜瓦尔索要的片酬高于片方给出的报价。杜瓦尔在2004年接受《60分钟》采访时进一步解释，他与阿尔·帕西诺的薪酬差距是他不满的焦点。虽然他并不期待与影片的主演获得同等水平的报酬，但两者之间的差距实在太大，难以接受。
在《教父3》中，乔治·汉密尔顿饰演的B.J.哈里森这个角色，隐约可见汤姆·哈根角色的影子。B.J.哈里森作为迈克尔·科莱昂的首席法律顾问，其在影片中的作用与汤姆·哈根相似，但仅限于功能层面。他通过处理文书工作和运用法律术语来推动剧情发展，因为让迈克尔亲自处理行政事务显然不现实。
然而，B.J.哈里森这个角色缺乏深度塑造，没有个人情节发展，只是作为一个提供信息、服务于整体叙事的工具存在。相比之下，汤姆·哈根在《教父》和《教父2》中，不仅承担了类似职责，还深入展现了其道德观、对科莱昂家族的忠诚、与迈克尔的友谊，以及被黑手党其他成员视为外人的复杂身份。B.J.哈里森则没有这些丰富内涵，只是在表面上替代了汤姆·哈根。
《教父3》相较于前两部作品口碑下滑明显，尽管后来科波拉的替代剪辑《迈克尔·科莱昂之死》有所改善，但该片仍是三部曲中的低谷。罗伯特·杜瓦尔饰演的汤姆·哈根缺席，是导致其口碑不佳的重要原因之一。汤姆·哈根虽不是《教父》的绝对主角，但他平衡了其他主要角色之间的关系。在《教父》中，他是科莱昂家的理智之声；在《教父2》中，他又处于迈克尔和弗雷多之间的中间位置，起到了关键的调和作用。
汤姆·哈根的存在，本可以为《教父3》增添一个极具分量的次要角色，与阿尔·帕西诺饰演的迈克尔形成呼应。他如同一个脚踏实地的普通人，置身于一群罪大恶极的黑帮分子之中。迈克尔成为新教父后，汤姆·哈根作为家族律师，是影片中最贴近普通观众的角色，其言行举止更像常人而非犯罪集团头目。缺少了汤姆·哈根，《教父3》在展现迈克尔与天主教会冲突等情节时，显得更加荒诞不经。
《教父》系列虽以黑帮为题材，但核心主题其实是家庭。《教父3》在这方面稍显逊色，很大程度上是因为缺少了汤姆·哈根。迈克尔的家庭成员寥寥无几，只有疏远的凯、回归的康妮，以及被低估的阿尔·内里。其余角色大多是新面孔。若罗伯特·杜瓦尔回归，影片或许会深入挖掘迈克尔与汤姆作为家族最后两位元老之间的情感纽带，两位黑帮老江湖之间也会产生诸多矛盾冲突。
在《教父3》里，迈克尔身边无人可回应，使得家庭关系的展现远不如前作精彩。除了康妮，其他人要么是迈克尔的下属，要么与他为敌。汤姆·哈根若在，本可成为影片中一个极具分量的次要角色，与阿尔·帕西诺饰演的迈克尔相得益彰。可惜，罗伯特·杜瓦尔的片酬问题，让这一设想化为泡影。
